五行归类方法采取"取象比类法"，将具有同一性、相似性的事物归于一大类。《素问·阴阳应象大论》中有详细五行归类："东方生风，风胜木，木生酸，酸生肝，肝生筋，筋生心，肝主目……"包括自然界的五音、五味、五色、五化、五气、五方、五季，人体五脏、五腑、五官、五体、情志、五声等，形成天人一体的统一观。
【相生相克关系】相生是五行之间相互资生、促进、助长的关系。相生次序：木生火，火生土，土生金，金生水，水生木。相克是某一事务对另一事物的抑制和约束作用，相克次序：木能克土，土能克水，水能克火，火能克金，金能克木。
五行之间是"以气不以质"的相互作用。如木生火：肝木生气生机旺盛，肝气情志调顺则易生心火；心火主阳气旺，可以温暖脾土助消化；脾土之气旺可以生津液以养肺金；肺金主肃杀收敛，主阳气内潜而养肾阳；肾气伏藏，肾阴积盈以滋养肝木。
相生相克是事物发展不可分割的两个方面。张介宾说："造化之机，不可无生亦不可无制，无生则发育无由，无制则亢而为害。"《素问》曰："亢则害，承乃制，制则生化。"
【相乘相侮】相乘就是乘虚而袭，指五行中某一行对其所胜一行过度克制。相侮就是持强凌弱，出现反克现象。《素问》曰："气有余，则制己所胜而侮所不胜；其不及，则己所不胜侮而乘之，己所胜轻而侮之。"
五行学说渗透到中医学各方面。五脏传变常依生克乘侮次序相传，治疗方法应该"见肝之病当先实脾"，脾旺不受邪而阻断传变过程。后世根据五行相生方式推出"滋水涵木""培土生金""金水相生"，按相克方式提出"壮水制火""扶土抑水""疏肝健脾"等治疗原则。
在诊断上，《灵枢》记载："肺病者，喘息鼻张；肝病者眦青；脾病者唇黄；心病者舌卷短，颜赤；肾病者，颧与颜黑。"从望诊推断五脏之病。在治疗上根据五脏虚实应用五行生克规律，如《难经》曰"虚则实其母，实则泻其子。"五行学说大大丰富了中医指导下的治疗方法。